Umas das principais dúvidas dos iniciantes quando estão fazendo uma montagem é como deixar parte da imagem transparente. Como podemos ver na imagem abaixo a transparência no GIMP é mostrada como sendo um monte de quadradinhos em tons de cinza.

Antes de começarmos, clique com o botão direito em cima da camada que você quer deixar com fundo transparente e clique em “adicionar canal alfa”.
Agora selecione toda a parte que você quiser deixar transparente. Para isso você pode usar ferramentas como a de seleção livre, ou vetor, ou até mesmo as clássicas ferramentas de seleção retangular ou elíptica.
Após selecionar, clique em “delete” no seu teclado.
Confira esse tutorial em vídeo: